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O Centro de Referência de Fibrose Quística do CHULN é o maior do País nesta área assistencial. Certificado pela DGS desde 2007 e integrado na Rede Europeia do centro de Referência de doenças raras do pulmão.
Integra a rede Europeia de ensaios clínicos em fibrose quística, tendo sido incluído duas vezes no top 5 de centros com ensaios clínicos de maior complexidade nesta área.
Dispõe de um hospital de dia e de um programa de telemedicina que inclui telemonitorização das exacerbações dos doentes graves e telerreabilitação.